BZIP Maf - BZIP Maf

bZIP_Maf
MafA homodimer.png'nin kristal yapısı
DNA'ya bağlı MafA homodimerinin kristal yapısı. PDB girişi 3a5t[1]
Tanımlayıcılar
SembolbZIP_Maf
PfamPF03131
Pfam klanCL0018
InterProIPR004826
SCOP21k1v / Dürbün / SUPFAM

bZIP Maf Maf'da bulunan bir alandır transkripsiyon faktörü proteinler. İçerir lösin fermuar (bZIP) alanı, transkripsiyon faktörünün dimerizasyon ve DNA bağlayıcı özellikleri. Maf uzatılmış homoloji bölgesi (EHR), proteinin N-terminalinde mevcuttur. Bu bölge (bitişik resimde sarı ile gösterilmiştir) sadece Maf ailesinde bulunur ve ailenin diğer lösin fermuarlarından daha uzun DNA motiflerini tanımasına izin verir. Bu motifler Maf tanıma öğesi (MARE) olarak adlandırılır ve 13 veya 14'tür baz çiftleri uzun. Özellikle iki kalıntılar başlangıcında sarmal H2, DNA'nın yan bölgesini tanıyacak şekilde konumlandırılmıştır.[2] Küçük Maf proteinler ile heterodimerleşmek Fos ve rekabetçi olarak hareket edebilir baskılayıcılar NF2-E2 transkripsiyon faktörünün.

Farede, Maf1 eksenel modellemede erken bir rol oynayabilir. Bu proteinlerdeki kusurlar bir nedenidir otozomal baskın retinitis pigmentosa. Sinirsel retina -özel lösin fermuar proteinleri bu familyaya aittir.

Referanslar

  1. ^ Kurokawa, H .; Motohashi, H .; Sueno, S .; Kimura, M .; Takagawa, H .; Kanno, Y .; Yamamoto, M .; Tanaka, T. (2009). "Alternatif DNA Tanınmasının Yapısal Temeli Maf Transkripsiyon Faktörleri". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 29 (23): 6232–6244. doi:10.1128 / MCB.00708-09. PMC  2786689. PMID  19797082.
  2. ^ Kusunoki H, Motohashi H, Katsuoka F, Morohashi A, Yamamoto M, Tanaka T (Nisan 2002). "MafG'nin DNA bağlama alanının çözüm yapısı". Nat. Struct. Biol. 9 (4): 252–6. doi:10.1038 / nsb771. PMID  11875518. S2CID  23687470.
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR004826