CTCFL - CTCFL

CTCFL
Tanımlayıcılar
Takma adlar	CTCFL, BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, CCCTC-bağlama faktörü gibi
Harici kimlikler	OMIM: 607022 MGI: 3652571 HomoloGene: 46476 GeneCard'lar: CTCFL
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 20 (insan)
Son	57,525,652 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 2 (fare)
Son	173,119,525 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması; • diziye özgü DNA bağlanması; • histon bağlama; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA bağlayıcı transkripsiyon aktivatör aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü; • metal iyon bağlama; • GO: 0000980 RNA polimeraz II cis-düzenleyici bölge dizisine özgü DNA bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • nükleik asit bağlanması; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü;
Hücresel bileşen	• hücre çekirdeği; • sitoplazma;
Biyolojik süreç	• genetik imprinting ile gen ifadesinin düzenlenmesi; • transkripsiyonun düzenlenmesi, DNA-şablonlu; • histon H3-K4 metilasyonunun düzenlenmesi; • Gamet oluşumunda yer alan DNA metilasyonu; • transkripsiyon, DNA şablonlu; • pozitif transkripsiyon düzenlemesi, DNA şablonlu; • gen ifadesinin pozitif düzenlenmesi; • Hücre döngüsü; • histon metilasyonu; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyon; • kromatin organizasyonu;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	140690
	664799
	ENSG00000124092
	ENSMUSG00000070495
	Q8NI51
	A2APF3
NM_001269040; NM_001269041; NM_001269042; NM_001269043; NM_001269044;
	NM_001269045; NM_001269046; NM_001269047; NM_001269048; NM_001269049; NM_001269050; NM_001269051; NM_001269052; NM_001269054; NM_001269055; NM_080618
	NM_001081387; NM_001355185
NP_001255969; NP_001255970; NP_001255971; NP_001255972; NP_001255973;
	NP_001255974; NP_001255975; NP_001255976; NP_001255977; NP_001255978; NP_001255979; NP_001255980; NP_001255981; NP_001255983; NP_001255984; NP_542185
	NP_001074856; NP_001342114
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Transkripsiyonel baskılayıcı CTCFL Ayrıca şöyle bilinir BORIS (Damgalı Sitelerin Düzenleyicisinin Kardeşi) bir protein insanlarda kodlanır CTCFL gen.^[5]

Fonksiyon

CCCTC bağlayıcı faktör (CTCF ), bir 11-çinko parmak gen regülasyonunda yer alan faktör, farklı DNA hedef bölgelerini bağlamak için farklı çinko parmakları kullanır. CTCF, metilasyona duyarlı izolatörler oluşturur X kromozomu inaktivasyonu. Transkripsiyonel baskılayıcı CTCFL (bu protein) bir paralog CTCF'nin esas olarak sitoplazmasında ifade edildiği görülmektedir. spermatositler esas olarak somatik hücrelerin çekirdeğinde ifade edilen CTCF'nin aksine. CTCF ve CTCFL normal olarak, erkek germ hücresi farklılaşması sırasında metilasyon işaretlerinin sıfırlanmasıyla ilişkili olan, birbirini dışlayan bir modelde ifade edilir.^[5]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000124092 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000070495 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b "Entrez Geni: CTCFL CCCTC-bağlama faktörü (çinko parmak proteini) benzeri".

daha fazla okuma

Klenova EM, Morse HC, Ohlsson R, Lobanenkov VV (2003). "Yeni BORIS + CTCF gen ailesi, normal biyoloji ve kanserin epigenetiğinde benzersiz bir şekilde yer almaktadır". Semin. Kanser Biol. 12 (5): 399–414. doi:10.1016 / S1044-579X (02) 00060-3. PMID 12191639.
D'Arcy V, Pore N, Docquier F, vd. (2008). "Transkripsiyon faktörü olan CTCF'nin bir paraloğu olan BORIS, göğüs tümörlerinde anormal şekilde ifade edilir". Br. J. Kanser. 98 (3): 571–9. doi:10.1038 / sj.bjc.6604181. PMC 2243163. PMID 18195709.
Woloszynska-Read A, James SR, Link PA, vd. (2008). "Yumurtalık kanserinde BORIS / CTCFL ekspresyonunun DNA metilasyonuna bağlı düzenlenmesi". Kanser İmmün. 7: 21. PMC 2935752. PMID 18095639.
Renaud S, Pugacheva EM, Delgado MD, ve diğerleri. (2008). "Damgalanmış sitelerin (BORIS) düzenleyicisinin kardeşi olan CTCF-paralog kanser-testis geninin ifadesi, CpG metilasyonu ve CTCF ve p53 transkripsiyon faktörleri tarafından modüle edilen üç alternatif destekleyici tarafından düzenlenir". Nükleik Asitler Res. 35 (21): 7372–88. doi:10.1093 / nar / gkm896. PMC 2175345. PMID 17962299.
Kholmanskikh O, Loriot A, Brasseur F, vd. (2008). "Melanomda BORIS ifadesi: MAGE-A1 aktivasyonu ile ilişki eksikliği". Int. J. Kanser. 122 (4): 777–84. doi:10.1002 / ijc.23140. PMID 17957795. S2CID 28681146.
Risinger JI, Chandramouli GV, Maxwell GL, vd. (2007). "Rahim kanserlerinde kanser / testis genlerinin küresel ekspresyon analizi, yüksek oranda BORIS ekspresyonu ortaya koymaktadır". Clin. Kanser Res. 13 (6): 1713–9. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2569. PMID 17363524.
D'Arcy V, Abdullaev ZK, Pore N, vd. (2006). "Meme kanseri hastalarının lökositlerinde saptanan BORIS potansiyeli, tümör oluşumunun erken bir belirteci olarak". Clin. Kanser Res. 12 (20 Pt 1): 5978–86. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-2731. PMID 17062669.
Hoffmann MJ, Müller M, Engers R, Schulz WA (2007). "Ürogenital malignitelerde CTCFL / BORIS ve OCT4 ekspresyonunun epigenetik kontrolü". Biochem. Pharmacol. 72 (11): 1577–88. doi:10.1016 / j.bcp.2006.06.020. PMID 16854382.
Hong JA, Kang Y, Abdullaev Z, vd. (2005). "CTCF ve BORIS'in NY-ESO-1 promoterine karşılıklı bağlanması, akciğer kanseri hücrelerinde bu kanser-testis geninin derepresyonuyla çakışıyor". Kanser Res. 65 (17): 7763–74. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0823. PMID 16140944.
Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). "BRCA1 COOH-terminal (BRCT) alanlarının fosfopeptit bağlanma özellikleri". J. Biol. Kimya. 278 (52): 52914–8. doi:10.1074 / jbc.C300407200. PMID 14578343.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Loukinov DI, Pugacheva E, Vatolin S, vd. (2002). "Epigenetik yeniden programlama olaylarıyla ilişkili yeni bir erkek germ hattına özgü protein olan BORIS, soma'daki damgalama işaretlerinin okunmasında yer alan yalıtkan protein olan CTCF ile aynı 11 çinko parmak alanını paylaşıyor". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (10): 6806–11. doi:10.1073 / pnas.092123699. PMC 124484. PMID 12011441.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, vd. (2002). "DNA dizisi ve insan kromozomu 20'nin karşılaştırmalı analizi". Doğa. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.

Dış bağlantılar

FactorBook CTCFL
İnsan CTCFL genom konumu ve CTCFL gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 20 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000124092 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000070495 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-5] "Entrez Geni: CTCFL CCCTC-bağlama faktörü (çinko parmak proteini) benzeri".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]