Consed - Consed - Wikipedia

Consed
Geliştirici (ler)David Gordon
İşletim sistemiUNIX, Linux, Mac OS X
TürBiyoinformatik
LisansTescilli
İnternet sitesihttp://bozeman.mbt.washington.edu/consed/consed.html

Consed[1] DNA'yı görüntülemek, düzenlemek ve bitirmek için bir programdır dizi derlemeleri. Başlangıçta ile oluşturulan sıra montajları için phrap, son sürümler ayrıca Newbler gibi diğer sekans birleştirme programlarını da destekler.

Tarih

Consed, başlangıçta büyük ölçekli kozmid av tüfeği dizileme için bir bitişik düzenleme ve sonlandırma aracı olarak geliştirilmiştir İnsan Genom Projesi. Genom sıralama merkezlerinde, Consed, phrap, son derece özdeş tekrarların neden olduğu montaj problemlerini çözün ve primer toplama ve boşluk kapatma gibi görevleri tamamlayın. Consed'in gelişimi, İnsan Genom Projesi. Mevcut Consed sürümleri, milyonlarca okumaya sahip çok büyük projeleri destekleyerek daha yeni sıralama yöntemleriyle kullanım sağlar. 454 sıralama ve Solexa sıralama. Consed ayrıca otomatik primer toplama gibi görevleri tamamlamak için gelişmiş araçlara sahiptir [2]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Gordon D, Abajian C, Yeşil P (1998). "Consed: Sıralı Sonlandırma için Grafiksel Bir Araç". Genom Araştırması. 8 (3): 195–202. doi:10.1101 / gr.8.3.195. PMID  9521923.
  2. ^ Gordon D, Desmarais C, Yeşil P (2001). "Otomatik Bitirme ile Otomatik Son İşlem". Genom Araştırması. 11 (4): 614–625. doi:10.1101 / gr.171401. PMC  311035. PMID  11282977.

Dış bağlantılar