Koku alma teorisi - Docking theory of olfaction - Wikipedia

koku alma teorisi bir koku molekülünün kokusunun bir dizi zayıflığa bağlı olduğunu öne sürmektedir. kovalent olmayan etkileşimler koku verici [bir ligand] ve onun arasında protein koku reseptörü (içinde bulundu burun epitel ), gibi elektrostatik ve van der Waals etkileşimler yanı sıra H-yapıştırma, dipol cazibe pi-istifleme metal iyon Katyon-pi etkileşimi, ve hidrofobik koku yapısına ek olarak etkiler.[1][2] Bu tür bir tanıma daha önce koku alma şekil teorisi,[3] Öncelikle moleküler şekil ve boyutu dikkate alan bu ikinci model, iki koku molekülü benzer şekil ve boyutlara sahip olabilir, ancak farklı zayıf moleküller arası kuvvet kümelerine sahip olabileceğinden ve bu nedenle farklı kombinasyonlarını etkinleştirdiğinden aşırı basitleştirilmiştir. koku reseptörleri. Daha önceki "kilit ve anahtar" ve "el içinde eldiven" modellerinin yerini, protein − ligand bağlanması, esnek moleküllerin distorsiyonunu göz önünde bulunduran daha incelikli resimlerle değiştirdi, böylece bağlanma ortaklarıyla en uygun etkileşimleri moleküler yerleştirme koku almayan G-protein bağlı reseptörler.

Tarih

1949'da, R.W. Moncrieff, Amerikan Parfümeri "Koku nedir: yeni bir teori" olarak adlandırılan Linus Pauling şekil temelli bir koku teorisi önermek için şekil temelli moleküler etkileşim kavramı.[4] Bu eskinin yerini aldı koku alma titreşim teorisi ve, şekle ek olarak bir dizi kovalent olmayan etkileşimi daha doğru bir şekilde yansıtmak için koku alma teorisini yeniden adlandırdı, hem ticari koku kimyasında hem de akademik moleküler biyolojide ana akım teori olmaya devam ediyor. Moncrieff'in teoriyi önermesinden üç yıl sonra John Amoore, insan koku alma sistemi tarafından ayırt edilebilen on binden fazla kokunun, görünür ışıkta algılanan renklerin spektrumuna benzer şekilde, her biri için koku reseptörleriyle ilişkili yedi temel birincil kokunun kombinasyonundan kaynaklandığını ileri sürdü. üç ana renk reseptörünün aktivasyonu ile üretilir.[5] Amoore'un yedi ana kokusu terli, spermöz, balıksı, malt, idrar ve misk kokusuydu. En ikna edici çalışması, içinde küresel moleküllerin bulunduğu yarım küre şeklindeki bir yuva yerleştirdiği kafurlu koku üzerinde yapıldı. kafur, siklooktan, ve naftalin bağlanabilir.

Ne zaman Linda Buck ve Richard Axel yayınladı Nobel Ödülü 1991'de koku alma reseptörleri üzerine yapılan araştırmaları kazanan, farelerde 1.000 G proteinine bağlı reseptörler koku alma için kullanılır.[6] Halihazırda bilinen tüm G-protein reseptörleri, oldukça spesifik konformasyonlara (şekillere) ve kovalent olmayan etkileşimlere sahip moleküllerin bağlanması (kenetlenmesi) yoluyla aktive edildiğinden, koku alma reseptörlerinin benzer bir şekilde çalıştığı varsayılmaktadır. İnsan koku alma sistemleri üzerine daha fazla araştırma, 347 koku alma reseptörü tanımladı.

Daha önce adlandırılan şekil teorisinin yeni bir versiyonu, aynı zamanda odotop teorisi veya Zayıf Şekil Teorisi, bir reseptörün, tek şeklin, tek kokunun eski modelinin aksine, herhangi bir kokudan aktif reseptörlerin bir kombinasyonunun sorumlu olduğunu savunur. Odotop modelindeki reseptörler, her moleküldeki yalnızca küçük yapısal özellikleri tanır ve beyin, birleşik sinyali yorumlanmış bir kokuya dönüştürmekten sorumludur. Yerleştirme teorisi üzerine yapılan güncel çalışmaların çoğu, orijinal sinyali oluşturan koku ve reseptör arasındaki özel etkileşimden ziyade sinirsel işlemeye odaklanmaktadır.[7]

Destek

Kokulu bir molekülün kenetlenmesi ile algılanan koku karakteri arasındaki karmaşık ilişkiyi aydınlatmak için çok sayıda çalışma yapılmıştır ve koku kimyagerleri, diğerleri arasında kehribar, sandal ağacı ve kafur kokuları için yapı modelleri önermişlerdir.

Tarafından yapılan bir çalışma Leslie B. Vosshall ve Andreas Keller, Doğa Sinirbilim 2004'te, rakip titreşim teorisinin birkaç anahtar tahminini test etti ve hiçbir deneysel destek bulamadı.[8][9] Veriler, Vosshall tarafından "şekil teorisiyle tutarlı" olarak tanımlanmış, ancak "şekil teorisini kanıtlamadıklarını" da eklemiştir.[10]

Başka bir çalışma da, kokuların moleküler hacminin, koku alma reseptörlerinin nöral yanıtlarının üst sınırlarını belirleyebileceğini göstermiştir. Meyve sineği.[11]

Bir 2015 Kimya ve Mühendislik Haberleri "şekil" ve "titreşim" tartışması hakkındaki makale, "acımasız, neredeyse yirmi yıl süren tartışmada ... bir yanda duyusal bilim adamlarının çoğunluğunun bizim koku reseptörleri belirli koku moleküllerini şekillerine ve kimyasal özelliklerine göre algılar. Öte yandan, bir koku reseptörünün bir koku molekülünün titreşim frekanslarını algıladığını öne süren bir avuç bilim adamı var ".[12] Makale, Block ve arkadaşları tarafından yürütülen yeni bir çalışmanın, koku alma reseptörlerinin moleküllerin titreşim durumlarını ayırt ettiğine dair hiçbir kanıt bulamadan, titreşimsel koku teorisini hedef aldığını gösteriyor. Özellikle, Block ve ark.[13] insan olduğunu bildir misk Heterolog kullanarak tanımlanan reseptör, OR5AN1 koku alma reseptörü ekspresyon sistemi ve siklopentadekanona güçlü yanıt verir ve Muscone, ayırt edemiyor izotopomerler bu bileşiklerin in vitro. Ayrıca, fare (metiltiyo) metantiyol tanıyan reseptör, MOR244-3 ve diğer seçilmiş insan ve fare koku alma reseptörleri, misk reseptörü OR5AN1 ile bulunan sonuçlara paralel olarak, ilgili ligandlarının normal, döteryumlanmış ve karbon-13 izotopomerlerine benzer şekilde yanıt verdi. Bu bulgulara dayanarak yazarlar, önerilen titreşim teorisinin insan misk reseptörü OR5AN1, fare tiyol reseptörü MOR244-3 veya diğerleri için geçerli olmadığı sonucuna varmışlardır. koku alma reseptörleri incelendi. Ek olarak, yazarlar tarafından yapılan teorik analiz, önerilen elektron transferi kokuların titreşim frekanslarının mekanizması, koku verici olmayan moleküler titreşim modlarının kuantum etkileriyle kolayca bastırılabilir. Yazarlar şu sonuca varıyor: "Bunlar ve elektron transferi -de koku alma reseptörleri, kapsamlı deneysel verilerimizle birlikte, titreşim teorisinin inandırıcılığına karşı çıkıyor. "

Bu çalışma hakkında yorum yaparken Vosshall, "PNAS'ta, Block ve diğerleri ...." şekil ve titreşim "tartışmasını koku psikofiziğinden ameliyathanelerin biyofiziğine kaydırın. Yazarlar, merkezi ilkelere karmaşık bir multidisipliner saldırı düzenler. sentetik organik kimya kullanarak titreşim teorisinin heterolog ifadesi koku alma reseptörleri ve kokunun titreşim teorisini destekleyecek hiçbir kanıt bulunmaması için teorik değerlendirmeler. "[3] Süre Torino Block'un "bütün organizmaların içindeki hücreler yerine bir tabaktaki hücreleri" kullandığını ve " koku alma reseptörü içinde insan embriyonik böbrek hücreleri karmaşık doğasını yeterince yeniden oluşturmaz koku alma... "Vosshall yanıt verir" Embriyonik böbrek hücreleri burundaki hücrelerle aynı değildir ... ama reseptörlere bakıyorsanız, bu dünyadaki en iyi sistemdir. "[12]

Zorluklar

  • Çok sayıda çalışmaya rağmen, yerleştirme teorisi, büyük öngörü gücüne sahip yapı-koku ilişkilerini henüz keşfetmedi.[14]
  • Farklı moleküler titreşimlere sahip benzer şekilli moleküllerin farklı kokuları vardır (metalosen deney ve döteryum moleküler değiştirme hidrojen ).[15] İçinde metalosen Turin, ferrosen ve nikelosen neredeyse aynı moleküler sandviç yapılara sahipken, farklı kokulara sahip olduklarını gözlemliyor. "Boyut ve kütlenin değişmesi nedeniyle, farklı metal atomlarının metal atomlarını içeren titreşimler için farklı frekanslar verdiğini" öne sürüyor.[15] titreşim teorisiyle uyumlu bir gözlem. Bununla birlikte, ferrocene zıt olarak, nikelosenin havada hızla ayrıştığı ve nikelosen için gözlemlenen, ancak ferrosen için gözlenmeyen sikloalken kokusunun, siklopentadien gibi eser miktarda hidrokarbon veren nikelosenin ayrışmasını basitçe yansıtabileceği kaydedilmiştir.[2] Benzer yapıya sahip moleküllerin kokusu ile ilgili zorluk, burjeonal ve silikon analogları ile elde edilen sonuçlara aykırıdır. lilial moleküler titreşimlerdeki farklılıklarına rağmen benzer kokulara sahip olan ve benzer şekilde en duyarlı insan reseptörü olan hOR17-4'ü aktive eden,[16] insanoğlunun misk reseptör OR5AN1 döteryumlanmış ve döteryumlu olmayanlara aynı şekilde yanıt verir Miskler[13] ve döteryumlanmış ve döteryumlanmamış kokulara koku alma reseptör tepkisinin tek nöron karşılaştırması.[17]
  • Benzer moleküler titreşimlere sahip farklı şekilli moleküller, benzer kokulara sahiptir ( karbon çift ​​bağ kükürt atomlar ve farklı şekilli kehribar kokular).
  • Gizleniyor fonksiyonel gruplar grubun karakteristik kokusunu gizlemez. Ancak bu her zaman böyle değildir, çünkü ortoikame edilmiş arilizonitriller[18] ve tiyofenoller[19] ana bileşiklerden çok daha az rahatsız edici kokulara sahiptir.
  • Şekle dayalı bir sistemle karıştırılma olasılığı en yüksek görünen benzer şekle sahip çok küçük moleküller, son derece farklı kokulara sahiptir. hidrojen sülfit. Bununla birlikte, Cu (I) gibi metallerin, aynı zamanda tiyoller gibi iyi metal koordine edici ligandlar olan güçlü kokulu uçucu maddeler için koku alma sırasında bir metalo-reseptör sahası ile ilişkili olabileceği öne sürülmüştür.[20][21] Bu hipotez, tiyole duyarlı fare ve insan koku alma reseptörlerinin spesifik vakalarında doğrulanmıştır.[22][23]
  • Koku literatüründeki koku tanımlamalarının, moleküler şekillerine göre titreşim frekansları ile daha güçlü bir şekilde ilişkili olduğu iddia edilmektedir.[24]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Horsfield, A. P .; Haase, A .; Turin, L. (2017). "Olfaksiyonda moleküler tanıma". Fizikteki Gelişmeler: X. 2 (3): 937–977. doi:10.1080/23746149.2017.1378594.
  2. ^ a b Blok, E. (2018). "Memeli koku ayrımcılığının moleküler temeli: Bir durum raporu". Tarım ve Gıda Kimyası Dergisi. 66 (51): 13346–13366. doi:10.1021 / acs.jafc.8b04471. PMID  30453735.
  3. ^ a b Vosshall LB (2015). "Tartışmalı bir koku teorisinin dinlenmesini sağlamak". Proc. Natl. Acad. Sci. Amerika Birleşik Devletleri. 112 (21): 6525–6526. Bibcode:2015PNAS..112.6525V. doi:10.1073 / pnas.1507103112. PMC  4450429. PMID  26015552.
  4. ^ Moncrieff, Robert Wighton (1949), "Koku nedir? Yeni Bir Teori", Amerikan Parfümeri, 54: 453
  5. ^ Amoore JE (1952). "İnsan koku alma reseptörlerinin stereokimyasal özgüllükleri". Parfümeri ve Uçucu Yağ Kaydı. 43: 321–330.
  6. ^ "2004 Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü".
  7. ^ "Linda B. Buck, PhD - HHMI.org". HHMI.org.
  8. ^ Keller A; Vosshall LB (2004). "Koku almanın titreşim teorisinin psikofiziksel bir testi". Doğa Sinirbilim. 7 (4): 337–338. doi:10.1038 / nn1215. PMID  15034588.
  9. ^ "Radikal bir teoriyi test etmek". Nat. Neurosci. 7 (4): 315. 2004. doi:10.1038 / nn0404-315. PMID  15048113.
  10. ^ TWOMBLY, RENEE (2004-03-26). "Rockefeller Üniversitesi - Newswire: İki Rockefeller fakültesi yeni HHMI araştırmacıları oluyor". Arşivlenen orijinal 2008-10-29 tarihinde. Alındı 2009-06-10.
  11. ^ Saberi M, Seyed-allaei (2016). "Drosophila'nın koku reseptörleri, kokuların moleküler hacmine duyarlıdır". Bilimsel Raporlar. 6: 25103. Bibcode:2016NatSR ... 625103S. doi:10.1038 / srep25103. PMC  4844992. PMID  27112241.
  12. ^ a b Everts S (2015). "Reseptör Araştırması Kokulu Bir Tartışmayı Yeniden Canlandırıyor". Chem. Müh. Haberler. 93 (18): 29–30.
  13. ^ a b Block E, vd. (2015). "Titreşimsel Olfaction Teorisinin İnanılmazlığı". Proc. Natl. Acad. Sci. Amerika Birleşik Devletleri. 112 (21): E2766 – E2774. Bibcode:2015PNAS..112E2766B. doi:10.1073 / pnas.1503054112. PMC  4450420. PMID  25901328.
  14. ^ Sat, CS (2006). "Kokunun Öngörülemezliği Üzerine". Angew. Chem. Int. Ed. 45 (38): 6254–6261. doi:10.1002 / anie.200600782. PMID  16983730.
  15. ^ a b Turin L (1996). "Birincil koku alma alımı için spektroskopik bir mekanizma". Chem. Duyular. 21 (6): 773–91. doi:10.1093 / chemse / 21.6.773. PMID  8985605.
  16. ^ Doszczak, L; Kraft, P; Weber, H-P; Bertermann, R; Triller, A; Hatt, H; Reinhold Tacke, R (2007). "Algı Tahmini: hOR17-4 Olfaktör Reseptör Modelinin Bourgeonal ve Lilial Silikon Analogları ile İncelenmesi". Angew. Chem. Int. Ed. 46 (18): 3367–3371. doi:10.1002 / anie.200605002. PMID  17397127.
  17. ^ Na, M .; Liu, M. T .; Nguyen, M.Q .; Ryan, K. (2019). "Döteryumlanmış ve döteryumlanmamış kokulara koku alma reseptör yanıtının tek nöron karşılaştırması". ACS Chem. Neurosci. 10 (1): 552–562. doi:10.1021 / acschemneuro.8b00416. PMID  30343564.
  18. ^ Pirrung, MC; Ghorai, S; Ibarra-Rivera, TR (2009). "Dönüştürülebilir İzonitrillerin Çok Bileşenli Reaksiyonları". J. Org. Kimya. 74 (11): 4110–4117. doi:10.1021 / jo900414n. PMID  19408909.
  19. ^ Nishide, K; Miyamoto, T; Kumar, K; Ohsugi, S-I; Düğüm, M (2002). "Zayıf bir kokuya sahip olan benzentiyol ve benzil merkaptanın sentetik eşdeğerleri: trialkilsilil grubunun koku azaltıcı etkisi". Tetrahedron Harf. 43 (47): 8569–8573. doi:10.1016 / s0040-4039 (02) 02052-x.
  20. ^ Crabtree, RH (1978). "Copper (I) - Olfactory Binding Site". J. Inorg. Nucl. Kimya. 1978 (40): 1453. doi:10.1016/0022-1902(78)80071-2.
  21. ^ Block, E .; Batista, V.S .; Matsunami, H .; Zhuang, H .; Ahmed, L. (2017). "Düşük moleküler ağırlıklı organosülfür bileşiklerinin memeli koku alma olayında metallerin rolü". Doğal Ürün Raporları. 34 (5): 529–557. doi:10.1039 / c7np00016b. PMC  5542778. PMID  28471462.
  22. ^ Duan, Xufang; Block, Eric; Li, Zhen; Connelly, Timothy; Zhang, Jian; Huang, Zhimin; Su, Xubo; Pan, Yi; Wu, Lifang; Chi, Qiuyi; Thomas, Siji; Zhang, Shaozhong; Anne, Minghong; Matsunami, Hiroaki; Chen, Guo-Qiang; Zhuang, Hanyi (2012). "Metal eşgüdümlü kokuların saptanmasında bakırın önemli rolü". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 109 (9): 3492–3497. Bibcode:2012PNAS..109.3492D. doi:10.1073 / pnas.1111297109. PMC  3295281. PMID  22328155.
  23. ^ Li, S .; Ahmed, L .; Zhang, R .; Pan, Y .; Matsunami, H .; Burger, J. L .; Block, E .; Batista, V. S .; Zhuang, H. (2016). "Kokulu sülfür: Bakır ve gümüş, insan koku reseptörü OR2T11'in düşük moleküler ağırlıklı tiollere tepkisini düzenler". Amerikan Kimya Derneği Dergisi. 138 (40): 13281–13288. doi:10.1021 / jacs.6b06983. PMID  27659093.
  24. ^ Takane SY; Mitchell JBO (2004). "EVA tanımlayıcıları ve hiyerarşik kümeleme kullanan bir yapı-koku ilişkisi çalışması". Org. Biomol. Kimya. 2 (22): 3250–5. doi:10.1039 / B409802A. PMID  15534702.

daha fazla okuma