Holin üst ailesi II - Holin superfamily II

Holin üst ailesi II bir üst aile varsayılan gözenek oluşturucu proteinler. Yedi farklı holin süper aileleri toplamda. Genel olarak, bu proteinlerin düzenlenmiş durumda bir rol oynadığı düşünülmektedir. hücre ölümü işlevsellik aileler ve bireysel üyeler arasında farklılık gösterse de. Holin üst ailesi II, TC ailelerini içerir:

Bu ailelerin dördü, Proteobakteriler ve nispeten küçük boyutlardadır, tüm süper aile içindeki proteinlerin ortalama boyutu 78 ± 14 amino asil kalıntısıdır (aas). Bazı istisnalar bulunabilir (yani 720 aas ile Lysis S ailesi proteini, TC # 1.E.1.1.7 ). De olduğu gibi holin süper ailesi I bu ailelerdeki proteinler genellikle 2 transmembran anahtar (TMS) sergiler. Superfamily II'deki 1 ve 6 numaralı aileler, Korunan Etki Alanları Veritabanı (CDD) sırasıyla Lysis S ve PHA00426 süper aileleri olarak, 7 ve 25 aileleri ise tanınan korunmuş alanlardan yoksundur.[1]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier, Milton H. (2013-11-01). "Bakteriyel holin ailelerinin ve süper ailelerin topolojik ve filogenetik analizleri". Biochimica et Biophysica Açta (BBA) - Biyomembranlar. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. ISSN  0006-3002. PMC  3788059. PMID  23856191.