LSM4 - LSM4

LSM4
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3JCR
Tanımlayıcılar
Takma adlar	LSM4, GRP, YER112W, LSM4 homolog, U6 küçük nükleer RNA ve mRNA bozulması ilişkili
Harici kimlikler	OMIM: 607284 MGI: 1354692 HomoloGene: 134555 GeneCard'lar: LSM4
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 19 (insan)
Son	18,323,274 bp
RNA ifadesi Desen
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• GO: 0001948 protein bağlama; • U6 snRNA bağlanması; • RNA bağlanması; • PH etki alanı bağlama;
Hücresel bileşen	• spliceosomal tri-snRNP kompleksi; • U6 snRNP; • P-vücut; • nükleoplazma; • nöron projeksiyonu; • spliceozomal kompleks; • hücre çekirdeği; • sitozol; • zar; • makromoleküler kompleks; • U4 / U6 x U5 tri-snRNP kompleksi; • U2 tipi prekatalitik spliceozom; • Lsm2-8 kompleksi;
Biyolojik süreç	• RNA işleme; • mRNA işleme; • spliceozomal snRNP montajı; • spliceosomal karmaşık montaj; • sitoplazmik mRNA işleme gövde montajı; • Deadenylation-bağımlı çürümede rol oynayan eksonükleolitik nükleer-transkripsiyonlu mRNA katabolik süreç; • RNA ekleme; • spliceozom yoluyla mRNA ekleme; • nükleer transkripsiyonlu mRNA katabolik süreç;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	25804
	50783
	ENSG00000130520
	ENSMUSG00000031848
	Q9Y4Z0
	Q9QXA5
	NM_012321; NM_001252129
	NM_015816
	NP_001239058; NP_036453
	NP_056631; NP_001345971
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

U6 snRNA ile ilişkili Sm benzeri protein LSm4 bir protein insanlarda kodlanır LSM4 gen.^[4]^[5]^[6]

Sm benzeri proteinler çeşitli organizmalarda tanımlanmıştır. dizi homolojisi Sm protein ailesi ile (bakınız SNRPD2; MIM 601061). Sm benzeri proteinler, bir ilmek olarak katlanan değişken uzunlukta bir bağlayıcı ile ayrılan 2 bölgeden oluşan Sm sekans motifini içerir. Sm benzeri proteinlerin kararlı bir heteromer içinde mevcut tri-snRNP önemli olan parçacıklar pre-mRNA ekleme. [OMIM tarafından sağlanır]^[6]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000130520 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Salgado-Garrido J, Bragado-Nilsson E, Kandels-Lewis S, Seraphin B (Ağu 1999). "Sm ve Sm benzeri proteinler, derin evrimsel kökene sahip iki ilişkili kompleks içinde birleşir". EMBO J. 18 (12): 3451–62. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3451. PMC 1171424. PMID 10369684.
^ Achsel T, Brahms H, Kastner B, Bachi A, Wilm M, Luhrmann R (Aralık 1999). "İnsan Sm benzeri proteinlerin halka şeklindeki bir heteromeri, U6 snRNA'nın 3'-ucuna bağlanır, böylece in vitro U4 / U6 dupleks oluşumunu kolaylaştırır". EMBO J. 18 (20): 5789–802. doi:10.1093 / emboj / 18.20.5789. PMC 1171645. PMID 10523320.
^ ^a ^b "Entrez Geni: LSM4 LSM4 homologu, U6 küçük nükleer RNA ile ilişkili (S. cerevisiae)".

daha fazla okuma

Şarkıcı J, Roberts-Ems J, Luthardt FW, Riggs AD (1980). "Fare erken embriyolarında, teratokarsinom hücrelerinde ve fare ve tavşanın yetişkin dokularında DNA'nın metilasyonu". Nükleik Asitler Res. 7 (8): 2369–85. doi:10.1093 / nar / 7.8.2369. PMC 342390. PMID 523320.
Friesen WJ, Dreyfuss G (2000). "Sm ve Sm benzeri (Lsm) proteinlerin spesifik dizileri, spinal musküler atrofi hastalığı gen ürünü (SMN) ile etkileşimlerine aracılık eder". J. Biol. Kimya. 275 (34): 26370–5. doi:10.1074 / jbc.M003299200. PMID 10851237.
Hu RM, Han ZG, Song HD, ve diğerleri. (2000). "İnsan hipotalamus-hipofiz-adrenal ekseninde gen ekspresyon profili ve tam uzunlukta cDNA klonlaması". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Eystathioy T, Peebles CL, Hamel JC, vd. (2002). "HLSm4'e otoantikor ve anti-Sm seralarda heptamerik LSm kompleksi". Artrit Romatizma. 46 (3): 726–34. doi:10.1002 / mad.10220. PMID 11920408.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ingelfinger D, Arndt-Jovin DJ, Lührmann R, Achsel T (2003). "İnsan LSm1-7 proteinleri, mRNA'yı parçalayan enzimler Dcp1 / 2 ve Xrnl ile farklı sitoplazmik odaklarda ortak lokalize olur". RNA. 8 (12): 1489–501. doi:10.1017 / S1355838202021726 (etkin olmayan 2020-09-10). PMC 1370355. PMID 12515382.CS1 Maint: DOI, Eylül 2020 itibariyle devre dışı (bağlantı)
Lehner B, Sanderson CM (2004). "İnsan mRNA Bozulması İçin Bir Protein Etkileşim Çerçevesi". Genom Res. 14 (7): 1315–23. doi:10.1101 / gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Fürst J, Schedlbauer A, Gandini R, vd. (2005). "ICln159, pleckstrin homoloji alanı benzeri bir yapıya katlanır. Kinazlar ve ekleme faktörü LSm4 ile etkileşim". J. Biol. Kimya. 280 (35): 31276–82. doi:10.1074 / jbc.M500541200. PMID 15905169.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, vd. (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Yang ZQ, Streicher KL, Ray ME, ve diğerleri. (2007). "İnsan meme kanserinde 8p11-p12 amplikonunda çoklu etkileşen onkojenler". Kanser Res. 66 (24): 11632–43. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2946. PMID 17178857.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, vd. (2007). "İnsan protein-protein etkileşimlerinin kütle spektrometresi ile geniş ölçekli haritalanması". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 19 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000130520 - Topluluk, Mayıs 2017

[2] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[3] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10369684-4] Salgado-Garrido J, Bragado-Nilsson E, Kandels-Lewis S, Seraphin B (Ağu 1999). "Sm ve Sm benzeri proteinler, derin evrimsel kökene sahip iki ilişkili kompleks içinde birleşir". EMBO J. 18 (12): 3451–62. doi:10.1093 / emboj / 18.12.3451. PMC 1171424. PMID 10369684.

[pmid10523320-5] Achsel T, Brahms H, Kastner B, Bachi A, Wilm M, Luhrmann R (Aralık 1999). "İnsan Sm benzeri proteinlerin halka şeklindeki bir heteromeri, U6 snRNA'nın 3'-ucuna bağlanır, böylece in vitro U4 / U6 dupleks oluşumunu kolaylaştırır". EMBO J. 18 (20): 5789–802. doi:10.1093 / emboj / 18.20.5789. PMC 1171645. PMID 10523320.

[entrez-6] "Entrez Geni: LSM4 LSM4 homologu, U6 küçük nükleer RNA ile ilişkili (S. cerevisiae)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]