Nicolas Le Novère - Nicolas Le Novère

Nicolas Le Novère
VIB-ABLS-2016-cropped.jpg
Doğum (1969-03-12) 12 Mart 1969 (yaş 51)
gidilen okul
BilinenBioModels Veritabanı, SBGN, SBML, MİRYAM
Bilimsel kariyer
Alanlar
Kurumlar
Akademik danışmanlar

Nicolas Le Novère bir ingiliz ve Fransızca biyolog. Araştırması modellemeye odaklanıyor Sinyal yolları ve paylaşmak için araçlar geliştirmek Matematiksel modeller.

Eğitim

Le Novère kendi Bakalorya -de Prytanée Ulusal Militaire. Biyoloji ve Biyokimya alanında MSc (1993) aldı. École Normale Supérieure, Hücresel Biyoloji ve Fizyoloji alanında bir BSc (1991) ve Moleküler ve Hücresel Alanlarda Doktora Farmakoloji (1998) Pierre ve Marie Curie Üniversitesi.[1] 1999'dan 2001'e kadar Doktora Sonrası Araştırmacı -de Cambridge Üniversitesi (İngiltere).

Araştırma

Le Novère kariyerinin ilk bölümü, laboratuvarında Jean-Pierre Changeux -de Pasteur Enstitüsü, çalışmaya odaklandı Nikotinik asetilkolin reseptörleri beyinde. Filogenilerini yeniden inşa etti,[2] tahmin[3] ve yapılarını modelledi.[4] Ayrıca mezensefalonun dopaminerjik nöronlarındaki alfa 6 alt biriminin rolünü araştırdı.[5][6]

Grubundaki doktora sonrası bursu sırasında Dennis Bray -de Cambridge Üniversitesi, bakterilerin altında yatan moleküler ağları modelledi. kemotaksis.[7][8] Le Novère daha sonra paylaşmak için geliştirme standartlarına dahil oldu Matematiksel modeller gibi SBML,[9] daha sonra editörü olacaktı.

2003 yılında Le Novère, Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü (EMBL-EBI). Grup okudu Sinyal yolları temel sinaptik plastisite özellikle allosterik kalsiyum sensörleri.[10][11][12]Buna paralel olarak, grubu sistem biyolojisinde grafiksel gösterim de dahil olmak üzere tutarlı bir standartlar setinin geliştirilmesini koordine etti. SBGN,[13] yardımcı notlar MİRYAM[14] ve MIASE,[15] diller SED-ML[16] ve PharmML ve ontolojiler[17] benzeri Sistem Biyolojisi Ontolojisi. O da yarattı BioModels Veritabanı[18] ve Identifiers.org[19] URI'ler.

Le Novère grubunu Babraham Enstitüsü 2012'den 2018'e.

Dergilerin yardımcı editörüydü BMC Sistemleri Biyolojisi ve NPJ Sistem Biyolojisi ve Uygulamaları Eylül 2018'e kadar. 2017'den 2018'e kadar 1000 Fakülte'nin Sistemler ve Ağ Biyolojisi bölüm başkanlığını yapmıştır.

Kıdemli üye Uluslararası Hesaplamalı Biyoloji Derneği 2017-2018 yılları arasında Yönetim Kurulu'nda görev yaptı.

Mahkumiyet

Eylül 2018'de Le Novère, bir çocuğun uygunsuz resimlerini indirdiğini ve aşırı pornografik bir imaja sahip olduğunu kabul ettiğinde 8 ay hapis cezasına çarptırıldı (2 yıl süreyle uzaklaştırıldı). [20][21][22] Daha sonra, çalıştığı Babraham Enstitüsünden ihraç edildi.

Referanslar

  1. ^ "Nicolas Le Novere CV". Alındı 25 Temmuz 2015.
  2. ^ Le Novère N, Changeux JP (1995). "Nikotinik asetilkolin reseptörünün moleküler evrimi: uyarılabilir hücrelerde multigen ailesinin bir örneği". Moleküler Evrim Dergisi. 40 (2): 155–172. doi:10.1007 / BF00167110. PMID  7699721.
  3. ^ Le Novère N, Corringer PJ, Changeux JP (1999). "Bir nikotinik reseptör alt birimi için geliştirilmiş ikincil yapı tahminleri. Çözücü erişilebilirliği ve deneysel verilerin 2D gösterime dahil edilmesi". Biyofizik Dergisi. 76 (5): 2329–2345. doi:10.1016 / S0006-3495 (99) 77390-X. PMC  1300207. PMID  10233052.
  4. ^ Le Novère N, Grutter T, Changeux JP (2002). "Nikotinik reseptörlerin hücre dışı alanının ve agonist ve Ca ++ bağlanma yerlerinin modelleri". ABD Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 99 (5): 3210–5. doi:10.1073 / pnas.042699699. PMC  122498. PMID  11867716.
  5. ^ Le Novère N, Zoli M, Changeux JP (1996). "Nöronal nikotinik reseptör a6 alt birimi mRNA, seçici olarak fare beyninin katekolaminerjik çekirdeklerinde yoğunlaşmıştır". Avrupa Nörobilim Dergisi. 8 (11): 2428–2439. doi:10.1111 / j.1460-9568.1996.tb01206.x. PMID  8950106.
  6. ^ Le Novère N, Zoli M, Léna C, Ferrari R, Picciotto MR, Merlo-Pich E, Changeux JP (1999). "İn vivo antisens oligonükleotid infüzyonu ile gösterilen, nikotin ile tetiklenen lokomosyonda a6 nikotinik reseptör alt biriminin rolü". NeuroReport. 10 (12): 2497–2501. doi:10.1097/00001756-199908200-00012. PMID  10574359.
  7. ^ Shimizu TS, Le Novère N, Levin MD, Beavil AJ, Sutton BJ, Bray D (2000). "Bakteriyel kemotaksiye karışan sinyal proteinlerinin bir kafesinin moleküler modeli". Doğa Hücre Biyolojisi. 2 (11): 792–796. doi:10.1038/35041030. PMID  11056533.
  8. ^ Duke, T.A. J .; Le Novère, N .; Bray, D. (2001). "Bir protein halkasında konformasyonel yayılma: Alaşımlara stokastik bir yaklaşım". Moleküler Biyoloji Dergisi. 308 (3): 541–553. doi:10.1006 / jmbi.2001.4610. PMID  11327786.
  9. ^ Hucka, M .; Finney, A .; Sauro, H. M .; Bolouri, H .; Doyle, J. C .; Kitano, H.; Arkın, A. P .; Bornstein, A. P .; Bray, B. J .; Cornish-Bowden, D .; Cuellar, A .; Dronov, A. A .; Gilles, S .; Ginkel, E. D .; Gor, M .; Goryanin, V .; Hedley, I. I .; Hodgman, W. J .; Hofmeyr, T. C .; Hunter, J. -H .; Juty, P. J .; Kasberger, N. S .; Kremling, J. L .; Kummer, A .; Le Novère, U .; Loew, N .; Lucio, L. M .; Mendes, P.; Minch, P .; Mjolsness, E. (2003). "Sistem biyolojisi biçimlendirme dili (SBML): Biyokimyasal ağ modellerinin temsili ve değişimi için bir ortam". Biyoinformatik. 19 (4): 524–531. doi:10.1093 / biyoinformatik / btg015. PMID  12611808.
  10. ^ Stefan MI, Edelstein SJ, Le Novère N (2008). "Kalmodülinin allosterik bir modeli, PP2B ve CaMKII'nin farklı aktivasyonunu açıklar". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 105 (31): 10768–10773. doi:10.1073 / pnas.0804672105. PMC  2504824. PMID  18669651.
  11. ^ Li L, Stefan MI, Le Novère N (2012). "Kalsiyum giriş frekansı, süresi ve genliği, kalsinörin ve CaMKII'nin göreceli aktivasyonunu farklı şekilde modüle eder". PLoS ONE. 7 (9): e43810. doi:10.1371 / journal.pone.0043810. PMC  3433481. PMID  22962589.
  12. ^ Lai M, Brun D, ​​Edelstein SJ, Le Novère N (2015). "Kalmodulin loblarının farklı hedefler tarafından modülasyonu: yarı-konformasyonel geçişlere sahip allosterik bir model". PLoS Hesaplamalı Biyoloji. 11 (1): e1004063. doi:10.1371 / journal.pcbi.1004063. PMC  4303274. PMID  25611683.
  13. ^ Le Novère N, Hucka M, Mi H, Moodie S, Shreiber F, Sorokin A, Demir E, Wegner K, Aladjem M, Wimalaratne S, Bergman FT, Gauges R, Ghazal P, Kawaji H, Li L, Matsuoka Y, Villéger A, Boyd SE, Calzone L, Courtot M, Dogrusoz U, Freeman T, Funahashi A, Ghosh S, Jouraku A, Kim S, Kolpakov F, Luna A, Sahle S, Schmidt E, Watterson S, Goryanin I, Kell DB, Sander C, Sauro H, Snoep JL, Kohn K, Kitano H (2009). "Sistem Biyolojisi Grafik Gösterimi". Doğa Biyoteknolojisi. 27 (8): 735–741. doi:10.1038 / nbt.1558. hdl:11693/38162. PMID  19668183.
  14. ^ Le Novère N, Finney A, Hucka M, Bhalla US, Campagne F, Collado-Vides J, Crampin EJ, Halstead M, Klipp E, Mendes P, Nielsen P, Sauro H, Shapiro B, Snoep JL, Spence HD, Wanner BL (2005). "Biyokimyasal Modellerin Ek Açıklamasında İstenen Minimum Bilgi (MIRIAM)". Doğa Biyoteknolojisi. 23 (12): 1509–1515. doi:10.1038 / nbt1156. PMID  16333295.
  15. ^ Waltemath D, Adams R, Beard DA, Bergmann FT, Bhalla US, Britten R, Chelliah V, Cooling MT, Cooper J, Crampin E, Garny A, Hoops S, Hucka M, Hunter P, Klipp E, Laibe C, Miller A , Moraru I, Nickerson D, Nielsen P, Nikolski M, Sahle S, Sauro HM, Schmidt H, Snoep JL, Tolle D, Wolkenhauer O, Le Novère N (2011). "Bir Simülasyon Deneyi Hakkında Minimum Bilgi (MIASE". PLoS Hesaplamalı Biyoloji. 7 (4): e1001122. doi:10.1371 / journal.pcbi.1001122. PMC  3084216. PMID  21552546.
  16. ^ Waltemath D, Adams R, Bergmann FT, Hucka M, Kolpakov F, Miller AK, Moraru II, Nickerson D, Sahle S, Snoep JL, Le Novère N (2011). "SED-ML ile tekrarlanabilir hesaplamalı biyoloji deneyleri - Simülasyon Deneyi Açıklama Biçimlendirme Dili". BMC Sistemleri Biyolojisi. 5: 198. doi:10.1186/1752-0509-5-198. PMC  3292844. PMID  22172142.
  17. ^ Courtot M, Juty N, Knüpfer C, Waltemath D, Zhukova A, Dräger A, Dumontier M, Finney A, Golebiewski M, Hastings J, Hoops S, Keating S, Kell DB, Kerrien S, Lawson J, Lister A, Lu J , Machne R, Mendes P, Pocock M, Rodriguez N, Villeger A, Wilkinson DJ, Wimalaratne S, Laibe C, Hucka M, Le Novère N (2011). "Sistem Biyolojisinde kontrollü kelime dağarcığı ve anlambilim". Moleküler Sistem Biyolojisi. 7: 543. doi:10.1038 / msb.2011.77. PMC  3261705. PMID  22027554.
  18. ^ Le Novère N, Bornstein B, Broicher A, Courtot M, Donizelli M, Dharuri H, Li L, Sauro H, Schilstra M, Shapiro B, Snoep JL, Hucka M (2006). "BioModels Veritabanı: Biyokimyasal ve Hücresel Sistemlerin Seçilmiş, Yayınlanmış, Kantitatif Kinetik Modellerinin Ücretsiz, Merkezi Bir Veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (90001): D689 – D691. doi:10.1093 / nar / gkj092. PMC  1347454. PMID  16381960.
  19. ^ Juty N, Le Novère N, Laibe C (2012). "Identifiers.org ve MIRIAM Registry: kalıcı kimlik sağlamak için topluluk kaynakları". Nükleik Asit Araştırması. 40 (Veritabanı sorunu): D580 – D586. doi:10.1093 / nar / gkr1097. PMC  3245029. PMID  22140103.
  20. ^ "Bilim adamının sekiz çocuğu taciz filmi". BBC haberleri. 4 Eylül 2018.
  21. ^ Pilgrim, Tom (4 Eylül 2018). "Cambridge'in en iyi bilim adamı çocuk istismarı videoları indirdiğini itiraf etti". Cambridge Haberleri.
  22. ^ "İşleri yoluna koymak". nlenov.wordpress.com. 20 Eylül 2018. Alındı 24 Ekim 2018.

Dış bağlantılar