Faj r1t holin ailesi - Phage r1t holin family

Lactococcus lactis Phage r1t Holin (r1t Holin) Ailesi (TC # 1.E.18 ), birkaç rlt holinin önemli ölçüde daha büyük olduğu bulunmasına rağmen (yani, 168 aa, 4 TMS,) tipik olarak boyutu yaklaşık 65 ve 95 amino asil kalıntısı (aas) arasında değişen varsayılan gözenek oluşturucu proteinler ailesidir. karakterize edilmemiş holin Rhodococcus opacus; TC # 1.E.18.1.9 ). Faj rlt holinleri, 2 TMS bölgesinin intragenik bir kopyasından kaynaklanan 4 TMS proteini ile 2 ila 4 transmembran segment (TMS) sergiler. R1t holin ailesine ait proteinlerin temsili bir listesi şu adreste bulunabilir: Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı.[1]

İşlev ve ifade

Lactococcus lactis faj r1t genomu iki bitişik gen içerir, orf48 ve orf49, Orf48'i kodlayan (TC # 1.E.18.1.1; 75 aas) ve bir lizin Orf49 (270 aas), muhtemelen bir N-asetil-muramoil-L-alanin amidaz, sırasıyla. Orf48, kısa bir dönüşlü bölge ile ayrılmış 2 varsayılan hidrofobik transmembran segmenti (TMS'ler) sergiler. Ayrıca hidrofobik N-terminal ve çok yüklü C-terminali. Orf48 / Orf49, faj rlt parçalama kasetini oluşturur. Orf49'un önemli bir rolü hücre parçalanması Orf48 tarafından kanıtlanmıştır.[2]

Orf48, Gp4 holinine homologtur Mikobakteri faj Ms6 (TC # 1.E.18.1.2 ).[3] Çoğu çift sarmallı (ds) DNA fajı gibi, mikobakteriyofaj Ms6, ev sahibinin parçalanmasını sağlamak için holin-endolizin sistemini kullanır. Endolizine ek olarak (lysA) ve holin (hol) genler, Ms6 üç yardımcı lizis proteinini kodlar. Gp1'in parçalama işlevi, gp1 hemen akış yukarı uzanan gen lysA, Ortaya çıktı.[4]

Catalão vd. gözlemlendi Escherichia coli Ms6 holin yokluğunda LysA ve Gp1'in birlikte ekspresyonundan sonra liziz. Gp1, holin protein sınıfına ait değildir, ancak birkaç özelliği paylaşır: moleküler şaperonlar. Yazarlar, Gp1'in LysA ile etkileşime girdiğini ve bu etkileşimin LysA'nın hedefine iletilmesi için gerekli olduğunu öne sürüyorlar. PhoA füzyonları bunu gösterdi Mycobacterium smegmatis LysA, verimli olması için gerekli olan Gp1 varlığında ekstrasitoplazmik ortama ihraç edilir. M. smegmatis liziz, Ms6 olarak gp1 silme, konak parçalama kusurlarına neden olur. Catalao vd. Ms6 endolizinin murein tabakasına verilmesinin holinden bağımsız bir şekilde şaperon benzeri bir protein olan Gp1 tarafından desteklendiğini öne sürdü.[4]

Faj r1t Orf48 tarafından katalize edilen taşıma reaksiyonu:

lizin (giriş) → lizin (çıkış)

Ayrıca bakınız

daha fazla okuma

Referanslar

  1. ^ "1.E.18 Lactococcus lactis Faj r1t Holin (r1t Holin) Ailesi". Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı. Alındı 2016-03-28.
  2. ^ van Sinderen, D .; Karsens, H .; Kok, J .; Terpstra, P .; Ruiters, M. H .; Venema, G .; Nauta, A. (1996-03-01). "Ilıman laktokokal bakteriyofaj r1t'nin sekans analizi ve moleküler karakterizasyonu" (PDF). Moleküler Mikrobiyoloji. 19 (6): 1343–1355. doi:10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02478.x. ISSN  0950-382X. PMID  8730875. S2CID  10182620.
  3. ^ Garcia, Miguel; Pimentel, Madalena; Moniz-Pereira, José (2002-06-01). "Mikobakteriyofaj Ms6 liziz genlerinin ifadesi, iki sigma (70) benzeri destekleyici tarafından yönlendirilir ve lider RNA'da bulunan bir transkripsiyon sonlandırma sinyaline bağlıdır". Bakteriyoloji Dergisi. 184 (11): 3034–3043. doi:10.1128 / jb.184.11.3034-3043.2002. ISSN  0021-9193. PMC  135080. PMID  12003945.
  4. ^ a b Catalão, Maria João; Gil, Filipa; Moniz-Pereira, José; Pimentel, Madalena (2010-08-01). "Mikobakteriyofaj Ms6, peptidoglikana endolizin verilmesinde yer alan şaperon benzeri bir proteini kodlar". Moleküler Mikrobiyoloji. 77 (3): 672–686. doi:10.1111 / j.1365-2958.2010.07239.x. ISSN  1365-2958. PMID  20545844. S2CID  29630013.

İtibariyle bu düzenleme, bu makale şuradan içerik kullanıyor: "1.E.18 Lactococcus lactis Faj r1t Holin (r1t Holin) Ailesi", altında yeniden kullanıma izin verecek şekilde lisanslanmıştır. Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported Lisansıama altında değil GFDL. İlgili tüm şartlara uyulmalıdır.