RivX sRNA - RivX sRNA

RivX
RivX ss.png
RivX sRNA'nın öngörülen ikincil yapısı
Tanımlayıcılar
SembolRivX
Diğer veri
RNA tipsRNA
Alan (lar)Streptococcus pyogenes
PDB yapılarPDBe

RivX sRNA bir kodlamayan RNA insan patojeninde virülansın iki temel düzenleyicisi arasındaki arayüzde yer alan molekül Streptococcus pyogenes (Grup A Streptoccus GAS olarak da bilinir): CovR / S sistemi[1] ve Mga regülatör.[2] Bu RNA, aşağı akışıyla birlikte protein kodlayan gen RivR, bu iki önemli düzenleme ağı arasında keşfedilen ilk bağlantılardır.[2] İki yolu birbirine bağlayan ekstra bir protein olan TrxR, bir yıl sonra tanımlandı.[3] Bu iki yolun bitişik olması sürekli olarak yüksek şiddet nın-nin S. pyogenes çeşitli çevresel koşullara rağmen.[2]

RivX'in RivR ile birlikte yazılacağı düşünülüyor mRNA transkripsiyon sonrası işleme sRNA'yı serbest bırakmadan önce. Aracılığıyla kodlamayan bir transkript olduğu bulundu Bölgeye yönelik mutagenez deney.[2]

Toplamda, GAS genomunun artık 75 toplam sRNA'yı kodladığı tahmin edilmektedir, bu sayı, yaklaşık olarak genom tarafından kodlanan transkripsiyon faktörlerinin sayısına eşittir ve bu, GAS'ta RNA düzenlemesinin önemini göstermektedir.[4]

Referanslar

  1. ^ Churchward G (Nisan 2007). "Janus'un iki yüzü: grup A streptokoklarda CovR / S tarafından virülans gen düzenlemesi". Moleküler Mikrobiyoloji. 64 (1): 34–41. doi:10.1111 / j.1365-2958.2007.05649.x. PMID  17376070.
  2. ^ a b c d Roberts SA, Scott JR (Aralık 2007). "RivR ve küçük RNA RivX: CovR düzenleyici kaskadı ve Mga regulon arasındaki eksik bağlantılar". Moleküler Mikrobiyoloji. 66 (6): 1506–1522. doi:10.1111 / j.1365-2958.2007.06015.x. PMID  18005100.
  3. ^ Leday TV, Gold KM, Kinkel TL, Roberts SA, Scott JR, McIver KS (Ekim 2008). "TrxR, grup A Streptococcus'ta Mga virülans düzenini etkinleştiren yeni bir CovR bastırılmış yanıt düzenleyici". Enfeksiyon ve Bağışıklık. 76 (10): 4659–4668. doi:10.1128 / IAI.00597-08. PMC  2546847. PMID  18678666.
  4. ^ Perez N, Treviño J, Liu Z, Ho SC, Babitzke P, Sumby P (Kasım 2009). "İnsan patojen grubu A Streptococcus'taki küçük düzenleyici RNA'ların genom çapında analizi". PLOS ONE. 4 (11): e7668. doi:10.1371 / journal.pone.0007668. PMC  2765633. PMID  19888332.

Dış bağlantılar