SRPK1 - SRPK1

SRPK1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1WAK, 1WBP, 3BEG, 4WUA
Tanımlayıcılar
Takma adlar	SRPK1, SFRSK1, SRSF protein kinaz 1
Harici kimlikler	OMIM: 601939 MGI: 106908 HomoloGene: 110962 GeneCard'lar: SRPK1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 6 (insan)
Son	35,921,342 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 17 (fare)
Son	28,622,709 bp
RNA ifadesi Desen
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• transferaz aktivitesi; • protein kinaz aktivitesi; • nükleotid bağlanması; • kinaz aktivitesi; • protein serin / treonin kinaz aktivitesi; • GO: 0001948 protein bağlama; • ATP bağlama; • magnezyum iyon bağlayıcı; • RNA bağlanması;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • hücre içi zara bağlı organel; • nükleer matris; • hücre zarı; • endoplazmik retikulum; • hücre çekirdeği; • sitozol;
Biyolojik süreç	• hücre farklılaşması; • GO: 0007243 hücre içi sinyal iletimi; • fosforilasyon; • mRNA işlemenin düzenlenmesi; • kromozom ayrımı; • mRNA işleme; • spliceozom aracılığıyla mRNA eklemesinin düzenlenmesi; • protein fosforilasyonu; • viral genom replikasyonunun negatif düzenlenmesi; • RNA ekleme; • viral genom replikasyonunun pozitif düzenlenmesi; • doğuştan bağışıklık sistemi; • GO: 0022415 viral süreç; • sperm kromatin yoğunlaşması; • spliceosomal karmaşık montaj; • gen ifadesinin düzenlenmesi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	6732
	20815
	ENSG00000096063
	ENSMUSG00000004865
	Q96SB4
	O70551
	NM_003137
	NM_016795
	NP_003128
	NP_058075
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Serin / treonin-protein kinaz SRPK1 bir enzim insanlarda kodlanır SRPK1 gen.^[5]^[6]^[7]

Fonksiyon

Bu gen, spesifik bir serin / arginin protein kinazı kodlar. SR (serin / arginin açısından zengin alan) ekleme faktörleri ailesi. Protein, çekirdeğe ve sitoplazmaya yerleşir. Hem yapıcı hem de kurucuların düzenlenmesinde rol oynadığı düşünülmektedir. alternatif ekleme ekleme faktörlerinin hücre içi lokalizasyonunu düzenleyerek. Bu gen için ikinci bir alternatif olarak uç uca eklenmiş transkript varyantı tarif edilmiştir, ancak tam uzunluk doğası belirlenmemiştir.^[7]

SRPK1 etkinleştirir damarlanma alternatif birleştirmeye bağlı olarak damar oluşumunu başlatan veya inhibe eden VEGF tarafından düzenlenir.

Tıbbi uygulamalar

Bazı kanserler vasküler endotelyal büyüme faktörü (VEGF) bağımlı (için damarlanma ). SRPK1, VEGF ekleme faktörünü etkinleştirir (fosforile eder). SRPK1 inhibitörleri (ör. 'SPHINX bileşikleri' ^[8]) prostat kanseri tedavisi olarak araştırma altında olan, Akut miyeloid lösemi ve neovasküler göz hastalığı.^[9]^[10]^[11]^[12]

Etkileşimler

SRPK1'in gösterdiği etkileşim ile:

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000096063 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000004865 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Gui JF, Lane WS, Fu XD (Temmuz 1994). "Bir serin kinaz, hücre döngüsündeki ekleme faktörlerinin hücre içi lokalizasyonunu düzenler". Doğa. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994Natur.369..678G. doi:10.1038 / 369678a0. PMID 8208298. S2CID 4275539.
^ Wang HY, Arden KC, Bermingham JR, Viars CS, Lin W, Boyer AD, Fu XD (Mayıs 1999). "Serin kinazların lokalizasyonu, SRPK1 (SFRSK1) ve SRPK2 (SFRSK2), fare ve insan kromozomlarında SR ailesine özgü ekleme faktörleri". Genomik. 57 (2): 310–5. doi:10.1006 / geno.1999.5770. PMID 10198174.
^ ^a ^b "Entrez Geni: SRPK1 SFRS protein kinaz 1".
^ "Yeni anti-anjiyojenik SRPK1 inhibitörlerinin geliştirilmesi" (PDF).
^ "Moleküler buluş prostat kanserinin yayılmasını durdurabilir". Günlük Bilim.
^ Mavrou A, Brakspear K, Hamdollah-Zadeh M, Damodaran G, Babaei-Jadidi R, Oxley J, Gillatt DA, Ladomery MR, Harper SJ, Bates DO, Oltean S (2014). "Prostat kanserinde potansiyel yeni hedefli terapötik strateji olarak serin-arginin protein kinaz 1 (SRPK1) inhibisyonu". Onkojen. 34 (33): 4311–9. doi:10.1038 / onc.2014.360. PMC 4351909. PMID 25381816.
^ Batson, Jennifer; Toop, Hamish D .; Redondo, Clara; Babaei-Jadidi, Roya; Chaikuad, Apirat; Wearmouth, Stephen F .; Gibbons, Brian; Allen, Claire; Tallant, Cynthia (17 Mart 2017). "Neovasküler Göz Hastalığı için Potansiyel Topikal Terapötikler Olarak Potansiyel, Seçici SRPK1 İnhibitörlerinin Geliştirilmesi". ACS Kimyasal Biyoloji. 12 (3): 825–832. doi:10.1021 / acschembio.6b01048. ISSN 1554-8937. PMID 28135068.
^ Vassiliou, George S .; Kouzarides, Tony; Yusa, Kosuke; Bates, David O .; Jeremias, Irmela; Bradley, Allan; Pina Cristina; Morris, Jonathan C .; Batson, Jennifer (2018-12-19). "SRPK1, BRD4 dahil epigenetik düzenleyicilerin izoform kullanımı üzerindeki etkiler yoluyla akut miyeloid lösemiyi sürdürür". Doğa İletişimi. 9 (1): 5378. Bibcode:2018NatCo ... 9.5378T. doi:10.1038 / s41467-018-07620-0. ISSN 2041-1723. PMC 6300607. PMID 30568163.
^ ^a ^b Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (Şubat 1998). "SRPK2: memeli hücrelerinde pre-mRNA ekleme faktörlerinin etkileşimine ve lokalizasyonuna aracılık etmede yer alan, farklı şekilde eksprese edilen SR proteinine özgü bir kinaz". J. Hücre Biol. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
^ Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (Ağu 2007). "Yapısal olarak benzersiz maya ve memeli serin-arginin protein kinazları, evrimsel olarak korunan fosforilasyon reaksiyonlarını katalize eder". J. Biol. Kimya. 282 (32): 23036–43. doi:10.1074 / jbc.M611305200. PMID 17517895.
^ Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (Şubat 2003). "Sisplatin tedavisinin serin / arginin açısından zengin bir nükleer protein CROP / Luc7A'nın benekli dağılımı üzerindeki etkisi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 324–9. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 03017-6. PMID 12565863.
^ Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (Nisan 1999). "SF2 / ASF'nin hücre altı lokalizasyonu, SR protein kinazları (SRPK'ler) ile doğrudan etkileşimle düzenlenir". J. Biol. Kimya. 274 (16): 11125–31. doi:10.1074 / jbc.274.16.11125. PMID 10196197.
^ Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (Kasım 2002). "Bir otoantijen kinaz sinyal yolunun tanımlanması için moleküler problar olarak insan otoimmün serumları". J. Exp. Orta. 196 (9): 1213–25. doi:10.1084 / jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631.
^ Varjosalo, Markku; Keskitalo, Salla; Van Drogen, Audrey; Nurkkala, Helka; Vichalkovski, Anton; Aebersold, Ruedi; Gstaiger, Matthias (Nisan 2013). "İnsan CMGC Kinaz Grubunun Protein Etkileşim Alanı". Hücre Raporları. 3 (4): 1306–1320. doi:10.1016 / j.celrep.2013.03.027. PMID 23602568.

daha fazla okuma

Colwill K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Cáceres JF, Pawson T, Fu XD (1996). "SRPK1 ve Clk / Sty protein kinazlar, serin / arginin açısından zengin ekleme faktörleri için farklı substrat spesifiklikleri gösterir". J. Biol. Kimya. 271 (40): 24569–75. doi:10.1074 / jbc.271.40.24569. PMID 8798720.
Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). "SRPK2: Memeli Hücrelerindeki Pre-mRNA Ekleme Faktörlerinin Etkileşimi ve Lokalizasyonunda Yer Alan Farklı Olarak Eksprese Edilmiş SR Proteine Özgü Kinaz". J. Hücre Biol. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
Papoutsopoulou S, Nikolakaki E, Giannakouros T (1999). "SRPK1 ve LBR protein kinazlar, özdeş substrat spesifiklikleri gösterir". Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (3): 602–7. doi:10.1006 / bbrc.1999.0249. PMID 10049757.
Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (1999). "SF2 / ASF'nin hücre altı lokalizasyonu, SR protein kinazları (SRPK'ler) ile doğrudan etkileşimle düzenlenir". J. Biol. Kimya. 274 (16): 11125–31. doi:10.1074 / jbc.274.16.11125. PMID 10196197.
Paillard F (1999). "Ailesel hiperkolesteroleminin tedavisi için yeni bir çözünür kimera". Hum. Gene Ther. 10 (7): 1093–4. doi:10.1089/10430349950018085. PMID 10340541.
Papoutsopoulou S, Nikolakaki E, Chalepakis G, Kruft V, Chevaillier P, Giannakouros T (1999). "SR proteinine özgü kinaz 1, testiste yüksek oranda ifade edilir ve protamin 1'i fosforile eder". Nükleik Asitler Res. 27 (14): 2972–80. doi:10.1093 / nar / 27.14.2972. PMC 148514. PMID 10390541.
Nikolakaki E, Kohen R, Hartmann AM, Stamm S, Georgatsou E, Giannakouros T (2001). "İskele bağlantı faktörü-B ile spesifik olarak etkileşime giren alternatif olarak eklenmiş bir SR protein kinaz 1 formunun klonlanması ve karakterizasyonu". J. Biol. Kimya. 276 (43): 40175–82. doi:10.1074 / jbc.M104755200. PMID 11509566.
Daub H, Blencke S, Habenberger P, Kurtenbach A, Dennenmoser J, Wissing J, Ullrich A, Cotten M (2002). "SRPK1 ve SRPK2'nin Hepatit B Virüsü Çekirdek Proteini Fosforile Eden Başlıca Hücresel Protein Kinazlar Olarak Tanımlanması". J. Virol. 76 (16): 8124–37. doi:10.1128 / JVI.76.16.8124-8137.2002. PMC 155132. PMID 12134018.
Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (2003). "Bir Otoantijen Kinaz Sinyal Yolunun Tanımlanması İçin Moleküler Problar Olarak İnsan Otoimmün Serası". J. Exp. Orta. 196 (9): 1213–25. doi:10.1084 / jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631.
Mylonis I, Giannakouros T (2003). "Protein kinaz CK2, SR proteinine özgü kinaz 1'i fosforile eder ve aktive eder". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (3): 650–6. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03055-3. PMID 12565829.
Aubol BE, Chakrabarti S, Ngo J, Shaffer J, Nolen B, Fu XD, Ghosh G, Adams JA (2004). "Alternatif ekleme faktörü / ekleme faktörü 2'nin işlemsel fosforilasyonu". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 100 (22): 12601–6. Bibcode:2003PNAS..10012601A. doi:10.1073 / pnas.1635129100. PMC 240664. PMID 14555757.
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Bağlantı AJ, Patton JG (2003). "Alternatif Eklemenin SRrp86 ve Etkileşen Proteinleri Tarafından Düzenlenmesi". Mol. Hücre. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Mylonis I, Drosou V, Brancorsini S, Nikolakaki E, Sassone-Corsi P, Giannakouros T (2004). "Protamin 1'in spermiyojenez sırasında iç nükleer membran protein lamin B reseptörü ile zamansal ilişkisi". J. Biol. Kimya. 279 (12): 11626–31. doi:10.1074 / jbc.M311949200. PMID 14701833.
Lee CG, Hague LK, Li H, Donnelly R (2004). "Topozomun tanımlanması, topoizomeraz II alfa içeren yeni bir çoklu alt birim kompleksi". Hücre döngüsü. 3 (5): 638–47. doi:10.4161 / cc.3.5.825. PMID 15034300.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Sitoskeletal regülasyon ve hücresel organizasyonda yer alan in vivo 14-3-3 bağlayıcı proteinlerin proteomik, fonksiyonel ve alan bazlı analizi". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000096063 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000004865 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid8208298-5] Gui JF, Lane WS, Fu XD (Temmuz 1994). "Bir serin kinaz, hücre döngüsündeki ekleme faktörlerinin hücre içi lokalizasyonunu düzenler". Doğa. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994Natur.369..678G. doi:10.1038 / 369678a0. PMID 8208298. S2CID 4275539.

[pmid10198174-6] Wang HY, Arden KC, Bermingham JR, Viars CS, Lin W, Boyer AD, Fu XD (Mayıs 1999). "Serin kinazların lokalizasyonu, SRPK1 (SFRSK1) ve SRPK2 (SFRSK2), fare ve insan kromozomlarında SR ailesine özgü ekleme faktörleri". Genomik. 57 (2): 310–5. doi:10.1006 / geno.1999.5770. PMID 10198174.

[entrez-7] "Entrez Geni: SRPK1 SFRS protein kinaz 1".

[8] "Yeni anti-anjiyojenik SRPK1 inhibitörlerinin geliştirilmesi" (PDF).

[9] "Moleküler buluş prostat kanserinin yayılmasını durdurabilir". Günlük Bilim.

[Mavrou2014-10] Mavrou A, Brakspear K, Hamdollah-Zadeh M, Damodaran G, Babaei-Jadidi R, Oxley J, Gillatt DA, Ladomery MR, Harper SJ, Bates DO, Oltean S (2014). "Prostat kanserinde potansiyel yeni hedefli terapötik strateji olarak serin-arginin protein kinaz 1 (SRPK1) inhibisyonu". Onkojen. 34 (33): 4311–9. doi:10.1038 / onc.2014.360. PMC 4351909. PMID 25381816.

[11] Batson, Jennifer; Toop, Hamish D .; Redondo, Clara; Babaei-Jadidi, Roya; Chaikuad, Apirat; Wearmouth, Stephen F .; Gibbons, Brian; Allen, Claire; Tallant, Cynthia (17 Mart 2017). "Neovasküler Göz Hastalığı için Potansiyel Topikal Terapötikler Olarak Potansiyel, Seçici SRPK1 İnhibitörlerinin Geliştirilmesi". ACS Kimyasal Biyoloji. 12 (3): 825–832. doi:10.1021 / acschembio.6b01048. ISSN 1554-8937. PMID 28135068.

[12] Vassiliou, George S .; Kouzarides, Tony; Yusa, Kosuke; Bates, David O .; Jeremias, Irmela; Bradley, Allan; Pina Cristina; Morris, Jonathan C .; Batson, Jennifer (2018-12-19). "SRPK1, BRD4 dahil epigenetik düzenleyicilerin izoform kullanımı üzerindeki etkiler yoluyla akut miyeloid lösemiyi sürdürür". Doğa İletişimi. 9 (1): 5378. Bibcode:2018NatCo ... 9.5378T. doi:10.1038 / s41467-018-07620-0. ISSN 2041-1723. PMC 6300607. PMID 30568163.

[pmid9472028-13] Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (Şubat 1998). "SRPK2: memeli hücrelerinde pre-mRNA ekleme faktörlerinin etkileşimine ve lokalizasyonuna aracılık etmede yer alan, farklı şekilde eksprese edilen SR proteinine özgü bir kinaz". J. Hücre Biol. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.

[pmid17517895-14] Lukasiewicz R, Velazquez-Dones A, Huynh N, Hagopian J, Fu XD, Adams J, Ghosh G (Ağu 2007). "Yapısal olarak benzersiz maya ve memeli serin-arginin protein kinazları, evrimsel olarak korunan fosforilasyon reaksiyonlarını katalize eder". J. Biol. Kimya. 282 (32): 23036–43. doi:10.1074 / jbc.M611305200. PMID 17517895.

[pmid12565863-15] Umehara H, Nishii Y, Morishima M, Kakehi Y, Kioka N, Amachi T, Koizumi J, Hagiwara M, Ueda K (Şubat 2003). "Sisplatin tedavisinin serin / arginin açısından zengin bir nükleer protein CROP / Luc7A'nın benekli dağılımı üzerindeki etkisi". Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (2): 324–9. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 03017-6. PMID 12565863.

[pmid10196197-16] Koizumi J, Okamoto Y, Onogi H, Mayeda A, Krainer AR, Hagiwara M (Nisan 1999). "SF2 / ASF'nin hücre altı lokalizasyonu, SR protein kinazları (SRPK'ler) ile doğrudan etkileşimle düzenlenir". J. Biol. Kimya. 274 (16): 11125–31. doi:10.1074 / jbc.274.16.11125. PMID 10196197.

[pmid12417631-17] Kamachi M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, Anderson P, Utz PJ (Kasım 2002). "Bir otoantijen kinaz sinyal yolunun tanımlanması için moleküler problar olarak insan otoimmün serumları". J. Exp. Orta. 196 (9): 1213–25. doi:10.1084 / jem.20021167. PMC 2194102. PMID 12417631.

[18] Varjosalo, Markku; Keskitalo, Salla; Van Drogen, Audrey; Nurkkala, Helka; Vichalkovski, Anton; Aebersold, Ruedi; Gstaiger, Matthias (Nisan 2013). "İnsan CMGC Kinaz Grubunun Protein Etkileşim Alanı". Hücre Raporları. 3 (4): 1306–1320. doi:10.1016 / j.celrep.2013.03.027. PMID 23602568.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]