D-stereospesifik aminopeptidaz - D-stereospecific aminopeptidase
| D-aminopeptidaz, alan B | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 ochrobactrum anthropi'den bir d-aminopeptidazın kristal yapısı | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | DAP_B | ||||||||
| Pfam | PF07930 | ||||||||
| Pfam klan | CL0013 | ||||||||
| InterPro | IPR012856 | ||||||||
| SCOP2 | 1ei5 / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| D-aminopeptidaz, alan C | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ochrobactrum anthropi'den bir d-aminopeptidazın kristal yapısı | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | DAP_C | ||||||||
| Pfam | PF07932 | ||||||||
| InterPro | IPR012857 | ||||||||
| SCOP2 | 1ei5 / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Moleküler biyolojide, D-stereospesifik aminopeptidaz (D-aminopeptidaz) EC 3.4.11.19 bir enzim hangi katalizler bir N terminali D-amino asit bir peptid, Xaa- | -Yaa-, burada Xaa tercihen D-Ala, D-Ser veya D-Thr. Glisin amid gibi D-amino asit amidler ve metil esterler de hidrolize edilir.
Bu bir dimerik her biri ile enzim monomer üçten oluşmak etki alanları. Alan B, bir beta varil sekizden oluşan antiparalel beta dizileri. Sekiz kalıntılı bir dizi ile katalitik alan olan A alanına bağlanır ve ayrıca etkileşim ikisiyle de etki alanları A ve C yoluyla kovalent olmayan tahviller. Etki alanı B muhtemelen etki alanı C'yi iyi bir konumda tutmada işlev görür. etkileşim katalitik alan ile.[1] Etki alanı C, bir beta varil sekiz antiparalelden oluşur beta dizileri. Kısa bir bağlayıcı dizisi ile B alanına bağlanır ve etkileşim geniş ölçüde katalitik alan olan A alanıyla. Gama döngü C alanının, katalitik cebin çeperinin bir kısmını oluşturur; etki alanı C aslında substrat ve inhibitör enzime özgüllük.
Dış bağlantılar
Referanslar
- ^ Bompard-Gilles C, Remaut H, Villeret V, Prange T, Fanuel L, Delmarcelle M, Joris B, Frere J, Van Beeumen J (Eylül 2000). "Ochrobactrum anthropi'den bir D-aminopeptidazın kristal yapısı, 'penisilin tanıyan enzim' ailesinin yeni bir üyesi". Yapısı. 8 (9): 971–80. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00188-X. PMID 10986464.
